Региональная комплексная автоматизированная система мониторинга и документационного обеспечения ветеринарного контроля (АС-МДО-ВК) предназначена для анализа и мониторинга угроз и развития инфекционных заболеваний сельскохозяйственных животных с отображением ветеринарно значимых объектов, их экономических связей, зон распространения заболеваний и угрожаемых зон в геоинформационной системе ситуационного центра профильного Комитета правительства региона. В системе формируются электронные паспорта ветеринарно значимых объектов как динамические информационные объекты, включающие набор сведений, необходимый и достаточный для анализа эпизоотической ситуации и принятия управленческих решений.
Система объединяет в себе систему анализа первичных данных, систему ведения нормативно-справочной информации (НСИ) и формирования отчетности, а также  геоинформационную систему, оперирующие с атрибутивными характеристиками ветеринарно значимых объектов.
Система функционирует по разным алгоритмам на различных стадиях ветеринарных мероприятий на контролируемой территории:
1. Стадия статистического анализа — на защищаемой территории нет инфекционных заболеваний, система собирает и оценивает данные о состоянии эпизоотического благополучия региона. Анализируются данные об изменении поголовья сельскохозяйственных животных по различным характеристикам, начиная от закупок, перемещения и заканчивая вынужденным убоем поднадзорных ветеринарной службе объектов, при этом в качестве первичной информации используется ветеринарная сопроводительная документация о ветеринарных объектах всех типов, данные ветеринарных лабораторий о заболеваемости на поднадзорной территории, выявленных и профилактируемых заболеваниях, данные по учету поголовья в частном секторе и иная информация, описывающая эпизоотические характеристики поднадзорной территории. Результатом работы является комплект ветеринарной отчетности.
2. Стадия предотвращения заноса инфекций на защищаемую территорию — анализу подвергаются данные, содержащиеся в ветеринарных сопроводительных документах на перемещение грузов, товаров, пищевых продуктов, комбикормов и иных объектов хозяйственной деятельности населения, позволяющих обеспечить занос и возникновение вспышки инфекций на защищаемой территории. Собираются и анализируются данные о проведенных анализах на пищевых и иных объектах на наличие инфекционных заболеваний, данные о продажах поднадзорных товаров и иные действия, фиксирующие возможность возникновения заболевания.
3. Стадия ликвидации вспышки инфекционного заболевания. На основе требований действующей нормативно-технической документации, данных кадастрового учета, прав землепользования и иных ограничений проектирует размещение объектов карантинной службы на транспортной сети региона, определяет прогнозируемые границы карантинных зон и постов. Результатом работы является проект действий карантинной службы на местности  на основе данных, накопленных на стадиях 1 и 2, при этом  рассчитываются средства и ресурсы, необходимые для блокирования зараженной территории.
Для обеспечения визуализации состояния ветеринарно значимых объектов, ведения справочников НСИ и формирования отчетности в АС-МДО-ВК используются следующие технологии:
•    система электронного документооборота (СЭД)
•    многопараметрический анализ данных (OLAP)
•    геоинформационная система (ГИС)
Реализуется распределенный доступ к данным электронных паспортов с системой разделения прав доступа, используются технологии криптозащиты данных, передаваемых по сетям общего пользования.
Ключевой особенностью системы является максимальное использование свободного программного обеспечения и безопасных информационных технологий.
Исходные данные (сведения о ветеринарно значимых объектах и показатели их состояния) вносятся в систему различными способами (рис. 1).
1. Данные по координатам ветеринарно значимых объектов могут поступать с приемников GPS/ГЛОНАСС, а также корректироваться или вводится вручную на рабочих местах Специалистов, оснащенных геоинформационой системой (ГИС)
2. Атрибутивные данные ветеринарно значимых объектов вводятся и корректируются с использованием Web-интерфейса на рабочих местах Редакторов базы данных.
3. Данные мониторинга показателей ветеринарно значимых объектов вводятся и корректируются с использованием Web-интерфейса на рабочих местах Операторов АС-МДО-ВК.
4. Средства ГИС позволяют также экспортировать данные, сформированные Специалистами в ГИС, напрямую в базу данных электронных паспортов ветеринарно значимых объектов, а также импортировать и экспортировать данные с использованием форматов электронных таблиц.
-    Системное программное обеспечение: GNU/Linux (Ubuntu 10.04/12.04 LTS, ALT Linux 6.0)
-    Сервер баз данных: PostgreSQL/PostGIS
-    Для web-интерфейса: web-сервер Apache, сценарии на Python, фреймворк django
-    Прикладное программное обеспечение на АРМ специалистов: ГИС QuantumGIS
-    Криптозащита: комплекс OpenSSL
-    Все перечисленное программное обеспечение является свободным программным обеспечением (СПО) по ГОСТ Р 54593-2011
-    PostgreSQL обеспечивает СРД на уровне пользователей, баз и таблиц
-    Django обеспечивает СРД для web-интерфейса
Все соединения шифруются (асимметричное шифрование).